یک روز تابستانی، توماس به یک لوکوموتیو قدیمی و رهاشده به نام هیرو برخورد می‌کند. هیرو که به شدت نیاز به تعمیر دارد، با خطر فرستاده شدن به قبرستان آهن‌آلات روبرو است؛ بنابراین توماس و دوستانش باید با همکاری یکدیگر، هیروی بیچاره را از این سرنوشت نجات دهند.

کاتسوما، پاپت، اسنودل و دیگر هیولاهای موشی باید جلوی دکتر استرنج‌گلاو بدجنس و دستیار بی‌دست‌و‌پایش، فیش‌لیپس را بگیرند تا تخم بزرگ موشلیگ تازه کشف‌شده را نابود نکنند.

اکتوناوت‌ها باید برای نجات موجودات اقیانوس از سونامی و فوران آتشفشان راهی پیدا کنند، زیرا آنها در حلقه ای آتش گرفتار شده اند و .....

داستان این انیمیشن درمورد اختانوردها و مأموریت ویژه آن ها برای نجات خانه شکننده و مرجانی یکی از دوستانشان، از دست موجوداتی است که ستاره های دریایی را می خورند و به صخره های مرجانی آسیب می رسانند.

اکتاناتس یک ماجراجویی زیر آب را آغاز می کنند و به مجموعه ای از غارهای چالش برانگیز می پردازند تا یک دوست کوچک هشت پا را به خانه خود بازگردانند تا به دریای کارائیب بروند.

فرمانروایی‌های بادکنکی ، اژدها پلیس‌های منگ و جادوگران شاد دقیقا چیزهایی هستند که پسری نوجوان به نام تری از داستان‌های جالب مادربزرگش به خاطر می‌آورد ، البته با این تفاوت که آنها واقعی هستند و مسلما آنچنان خوش‌برخورد نیستند و… 

توماس در راه رساندن وسایل های مربوط به راه آهن به ایستگاه است اما در بین مسیر به او پیامی اشتباه مخابره می شود و باعث می شود او از مسیر خارج شود و ....